Władzami Towarzystwa są:

• Walne Zgromadzenie Członków – najwyższa władza Towarzystwa;
• Zarząd Główny – składa się z Prezesa i 8 członków Prezydium, Prezesa Honorowego Towarzystwa, Przewodniczących Zarządów Oddziałów i Przewodniczących Sekcji Naukowych;
• Prezydium Zarządu Głównego – Prezes i 8 członków Zarządu, Prezes Honorowy Towarzystwa oraz Prezes poprzedniej kadencji przez pierwszy rok działalności nowego Zarządu;
• Główna Komisja Rewizyjna;
• Sąd Koleżeński.

Kadencja władz trwa cztery lata.